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细胞RNA提取实验
RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套口罩帽子,不要交流,打喷嚏,样品尽可能盖严。
1、细胞。取出六孔板,弃去培养基,用预冷的PBS洗2遍,一定要把PBS吸干净。加入1ml Trizol裂解细胞,用细胞刮刮下细胞,转移到一个新的无酶1.5ml EP管中,室温静置5min(使核酸蛋白复合物完全分离)。
B、组织。50-100mg组织/ml Trizol加入Trizol,如果你不想去称量,用匀浆器匀浆(匀浆器需要在用之前用DEPC水泡过,消毒)。转移到一个新的无酶1.5ml EP管中,室温静置5min。
2、加氯仿1/5 Trizol体积 ,把EP管盖子盖紧,用手上下左右晃动10次左右(摇晃时应注意离心管盖以防未盖紧使溶液漏出),使其混匀(在室温下静置5-10 min(避免涡旋震荡,以免DNA链断裂)。然后,运用低温离心机4℃,1,0000 rpm/min,离心15min。分为3层,水相层包含RNA在上层,有机层在下层,中间层是DNA和蛋白质。
3、小心吸取上清液,切忌吸出白色中间层,转移至另一新的无酶EP管中。加入等体积的异丙醇(大约为500μl),用手上下摇晃,室温静置10min。低温离心机4℃,离心15min,12,000 rpm/min。
4、倒掉上清液,加1ml 75%无水乙醇 ,用手轻轻震动洗涤管壁,低温离心机4℃,离心5min,12,000 rpm/min,为了避免减少盐物质及碳源物质干扰,此处建议用75%无水乙醇清洗两次。
5、上清倒掉,放置室温(EP管倒置在滤纸上),使RNA干燥沉淀(注意不要加热干燥或离心,要不然RNA将很难溶解)。加DEPC水30μl于EP管中。
6、测RNA浓度:将仪器打开,先用DEPC水调零(3次)。吸取1-2μl待测RNA,慢慢滴于仪器上,记录RNA浓度值,以便在逆转录时使用。同时至少要记录260/280值(1.8-2.1),纯RNA的OD260/OD280的比值为2.0。
7、逆转录:将RNA溶液快速离心,同时将无酶EP管放于冰上,配置10μl的体系,加gDNA Eraser 1μl,5×gDNA Eraser Buffer 2.0μl,RNA溶液质量根据浓度计算最好超过1μg(RNA浓度最好在500-1000),最后加RNase free ddH2O至10μl,用涡旋震荡混匀。将反应液置于室温5min。加入上述变性、退火反应后的EP管中,为20μl体系。